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新疆医科大学第二附属医院的特色和优势科室如下：
心血管内科：是自治区级重点学科，是集医疗、教学、科研、预防为一体的临床科室。
骨科：自治区级重点学科，是新疆地区最早开展脊柱外科、关节外科、创伤骨科的专业科室。
神经外科：自治区级重点学科，是新疆地区最早开展神经外科手术的专业科室之一。
泌尿外科：是自治区级重点学科，是新疆地区最早开展泌尿外科手术的专业科室之一。
重症医学科：是自治区级重点学科，是新疆地区最早开展重症医学的专业科室之一。
麻醉科：是自治区级重点学科，是新疆地区最早开展麻醉的专业科室之一。
医学影像中心：是自治区级重点学科，是新疆地区最早开展医学影像的专业科室之一。
临床护理：是自治区级重点学科，是新疆地区最早开展临床护理的专业科室之一。
新疆维吾尔自治区第一济困医院的特色和优势科室如下：
皮肤科：是医院的特色科室，拥有多位知名专家和先进的设备，擅长治疗各种皮肤病和性病。
肛肠科：是医院的特色科室，拥有多位知名专家和先进的设备，擅长治疗各种肛肠疾病。
疼痛科：是医院的特色科室，拥有多位知名专家和先进的设备，擅长治疗各种疼痛疾病。
中医科：是医院的特色科室，拥有多位知名专家和先进的设备，擅长治疗各种中医疾病。
口腔科：是医院的特色科室，拥有多位知名专家和先进的设备，擅长治疗各种口腔疾病。
眼科：是医院的特色科室，拥有多位知名专家和先进的设备，擅长治疗各种眼科疾病。
耳鼻喉科：是医院的特色科室，拥有多位知名专家和先进的设备，擅长治疗各种耳鼻喉疾病。
