孤立性肺结节通过实验室检查（血常规、肿瘤标志物、结核γ干扰素释放试验等）、影像学检查（CT、MRI、PET-CT）、气管镜检查、组织病理学检查来确诊。实验室检查实验室检查对肺结节的诊断有辅助作用。对于结核、肺炎、肺恶性肿瘤可有一些实验室检查阳性结果提供一个诊断的方向。影像学检查影像学检查在孤立性肺结节的诊断中具有重要意义。影像学检查多以胸部CT或胸部增强CT为主，可以显示病灶的局部影像特征，为后续的处理提供依据。头颅MRI、全身骨显像、腹部超声在评价肺恶性肿瘤有无远处转移中有重要作用。PET-CT检查可用于肺结节的鉴别诊断、肺癌分期、转移灶检测、疗效评价、肿瘤复发转移监测等。现在临床上已得到广泛应用。气管镜检查观察气管和支气管中的病变，并取得病理证据（包括在直视下钳取、刷检、肺泡灌洗、经气管的针刺活检）。对于怀疑肺癌患者，对制定手术切除范围、方式有重要意义。对于孤立性肺结节患者可能多无阳性发现。组织病理学检查病理诊断为诊断肺结节的金标准。病理诊断的标本可通过多种渠道获得，如气管镜活检、经皮的病灶穿刺活检、经手术的取材等。