急性肺源性心脏病的预后取决于肺栓塞的部位和面积和肺功能状况，大多数病人经过积极治疗可以明显缓解症状，少数病人因反复肺栓塞可发展为慢性肺动脉高压。慢性肺源性心脏病常反复急性加重，肺功能发生不可逆转的损害，多数难以治愈，但经积极治疗可以改善病人生活质量。