本病以药物治疗为主，治疗需针对病因，遵循个体化原则。治疗目的是缓解消化不良症状和改善胃黏膜炎症。根除幽门螺杆菌主要是通过多种药物联合治疗。抑酸药可以减少胃酸分泌，减轻胃酸对胃和食管黏膜的刺激，缓解反酸和烧心症状。常用药物有奥美拉唑、雷贝拉唑、泮托拉唑等。抗酸药可以中和胃酸，减轻反酸、烧心等症状。常见药物有铝碳酸镁、铝镁加、氢氧化铝等。胃黏膜保护药可以增强胃黏膜的屏障功能，减轻胃黏膜损害。常用的药物有铝碳酸镁、硫糖铝、替普瑞酮、瑞巴派特等。促胃肠动力药可以加速胃内食物排空，减轻反流症状。常用的药物有多潘立酮、莫沙必利、伊托必利等。