肠套叠主要通过空气或钡剂灌肠复位和手术治疗。一般婴幼儿患者采取空气或钡剂灌肠复位，成人患者采取手术治疗。空气或钡剂灌肠复位空气或钡剂灌肠复位是治疗肠套叠的首选方法，早期肠套叠复位成功率高。手术治疗如果空气或钡剂灌肠复位失败，肠套叠超过48小时，或者医生怀疑有肠坏死，医生可能采用手术治疗。常用手术为肠段切除吻合术。