反流性咽喉炎发病机制不完全清楚，一般认为是多种因素及机制同时作用的结果。屏障结构功能障碍。直接刺激：咽喉部抗酸能力较弱，咽喉黏膜缺乏食管黏膜表面的抗酸保护机制，反流的胃蛋白酶和酸性物质直接刺激咽喉的黏膜，造成损伤，导致咽部不适。迷走神经反射：反流物刺激食管远端发生的迷走神经反射引起清嗓及慢性咳嗽，损伤声带黏膜。生活饮食习惯欠佳、精神抑郁紧张等。