在治疗上，以改善心肌营养、免疫调节、抗心力衰竭、抗心律失常等对症治疗为主。一般治疗卧床休息，以减轻心脏负担和机体耗氧量。患儿出现烦躁不安、心前区疼痛、腹痛及肌痛等症状时，可对症处理。改善心肌营养如1，6-二磷酸果糖、大剂量维生素C、辅酶Q10、黄芪等，具有抗病毒和保护心肌的作用。免疫调节使用免疫球蛋白，具有中和病毒抗体、调节免疫，减轻心肌细胞损害等作用。抗心力衰竭使用洋地黄、血管扩张药、磷酸二酯酶抑制剂、利尿药等药物，可以减轻心力衰竭症状。抗心律失常室上性心动过速可以使用洋地黄治疗，比较有效；室性心动过速可静脉滴注利多卡因或胺碘酮。积极治疗后，若室性心律失常仍快速进展为室性纤颤（这种情况在小婴儿更易发生），需要进行除颤治疗。若发生完全性房室传导阻滞，需要安置临时起搏器，甚至永久起搏器。