确诊小儿支原体肺炎主要依靠体格检查、影像学检查、病原学检查等帮助确诊。体格检查了解心肺有无异常的情况。影像学检查通过胸部X线、CT检查，了解肺部病变情况，为确诊提供依据。病原学检查分离培养通过培养从咽喉、鼻腔、体液等分离出来的样本，确定感染的病原菌类型。但培养时间较长，早期诊断意义不大。血清学检查通过明胶颗粒凝集试验和酶联免疫吸附试验等特异性的血清学试验可确诊支原体感染。