医生可通过体格检查、喉镜检查等诊断会厌囊肿。体格检查：小的囊肿多无症状，大的囊肿可有喉异物感，甚至呼吸困难。喉镜检查多见囊肿位于会厌舌面，大者充满整个会厌谷，巨大的囊肿上界可达口咽。囊肿广基或带蒂，呈半球形，表面光滑，半透明，灰白色，微黄或淡红。囊壁一般甚薄，触之有波动感，注射器可抽吸出黏稠内容物，色乳白或褐色，如继发感染，则为脓液。