慢性扁桃体炎多由急性扁桃体炎反复发作转变而来，也可因扁桃体隐窝引流不畅，隐窝内细菌或病毒滋生发生感染。反复发作的急性扁桃体炎使机体抵抗力下降，细菌易在隐窝内繁殖，从而引起本病。鼻腔内有鼻窦感染时，也可诱发本病。猩红热、麻疹、流感、白喉等急性传染病，也可引起慢性扁桃体炎。肥大型扁桃体炎通常呈家族式发病，因此有家族史的人也容易出现本病。