目前治疗感染性心内膜炎主要通过药物和手术治疗。药物治疗抗生素的应用是治疗心内膜炎最重要的措施。根据致病菌培养结果和致病菌对抗生素的敏感性选择抗生素。同时使用至少2种有协同作用的抗生素，保证足量、足疗程。手术治疗如果出现药物治疗无效、严重并发症、感染难以控制等情况，医生会考虑通过手术治疗。通过切除感染物、引流脓肿及修复受损组织，可避免病情恶化，预防栓塞。