确诊念珠菌性包皮龟头炎需要进行体格检查、病原学检查。体格检查包皮及龟头潮红，丘疹，可有少许鳞屑或渗出。包皮内板和冠状沟处表面附着白色乳酪状膜，易被刮除。包皮内板增厚，无光泽。病原学检查包皮垢涂片镜检。包皮垢真菌培养可见有致病菌生长，可同时进行药敏试验以指导治疗用药。