甲状腺功能减退症临床表现多样，按起病年龄可分三型：功能减退始于胎儿或新生儿称呆小病；功能减退始于发育前儿童者，称幼年甲状腺功能减退症；功能减退始于成人者，称成年甲状腺功能减退症。呆小病出生后数周可以出现症状：皮肤苍白、增厚，褶皱、鳞屑多，面色苍白或蜡黄。前额多皱纹。鼻子短，鼻梁扁塌，鼻尖上翘。嘴唇厚，嘴常张开，并容易流口水。舌头大并向外伸。四肢粗短，身材矮小。体温偏低。生长发育明显落后于同龄人，成年后常身材矮小。脖子变粗。永久性智力、听力、语言等障碍。幼年甲状腺功能减退症幼儿发病者发育落后和容貌改变没有呆小病明显。其他与呆小病相似。大龄儿童及青春期发病者面部、下肢水肿；全身乏力；怕冷；皮肤苍黄而干燥；反应迟钝；便秘。成年甲状腺功能减退症动作缓慢、精神萎靡、易疲劳、嗜睡；心跳过缓；智力减退，记忆力减退，理解能力下降，注意力不集中；怕冷、少汗；皮肤干燥粗厚，色泽苍白或者蜡黄，皮肤温度偏低；食欲下降反而体重增加；表情呆滞、颜面浮肿、鼻唇增厚；头发稀疏干脆、眉毛脱落（尤其是眉梢）；发音低哑；厌食、腹胀、顽固性便秘；头昏、目眩、耳鸣、夜盲；男性阳萎、性欲减退，女性月经过多；肌肉关节疼痛等。