新生儿黄疸分为生理性黄疸和病理性黄疸，不同情况病因可有不同。生理性黄疸新生儿红细胞数量多、寿命短，红细胞破坏后产生胆红素多。肝细胞处理、排泄胆红素的能力不足。进入肠道的结合胆红素经酶的水解作用会再次吸收入血液。病理性黄疸胆红素生成过多：红细胞增多症，血管外溶血（头颅血肿、颅内出血），同族免疫性溶血（母子血型不合溶血），感染，肠肝循环增加（巨结肠、肠道闭锁），葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症。肝脏胆红素代谢障碍：缺氧、窒息造成肝功能损伤，先天性染色体疾病，药物（磺胺、水杨酸盐、吲哚美辛、毛花苷丙可竞争胆红素结合位点而影响转运排泄），先天性甲状腺功能低下，垂体功能低下、21-三体综合征等。胆汁排泄障碍：胆道闭锁、新生儿肝炎、半乳糖血症、酪氨酸血症等引起的肝细胞损害，肠道外营养引起的胆汁淤积。