毛囊角化病可采用一般治疗、系统治疗、局部治疗等。一般治疗紫外线加重本病，应该避免日晒，局部用遮光剂及维生素C可阻止某些患者发作。系统治疗口服异维A酸或阿维A可用于严重病例，环孢素可用于控制严重的发作。发作期口服抗生素有效。可试用氯喹。局部治疗外用0.1%维A酸软膏、尿素软膏、阿达帕林、5%氟尿嘧啶软膏等；对肥厚性损害可用激光、冷冻、皮肤磨削术或者切除后植皮。