卵巢囊肿治疗后的效果与年龄、是否恶性、囊肿的体积和大小等因素有关。良性囊肿如果积极治疗，可以根治。恶性囊肿经过满意的手术或/和术后化疗，可获得完全缓解。但复发率高，易出现化疗耐药最终死亡。如果不及时处理，良性囊肿可能恶变，恶变的囊肿迅速发展和转移，可导致死亡。