本病的发生，可能与遗传和环境有关。遗传因素某些基因突变，可能会增加多系统萎缩患病风险。环境因素有研究提示职业、生活习惯（如接触有机溶剂、重金属，从事农业工作）可能增加多系统萎缩发病风险，但这些危险因素尚未完全证实。