医生会结合患者的流行病学史（包括不安全性生活史、静脉注射毒品史、输入未经抗HIV抗体检测的血液或血液制品、HIV抗体阳性者所生子女或职业暴露史等）、临床表现和实验室检查等综合分析，做出诊断。实验室检查符合下列一项者即可诊断：HIV抗体筛查试验阳性和HIV补充试验阳性（抗体补充试验阳性或核酸定性检测阳性或核酸定量＞5000copies/ml）。病毒培养分离出人类免疫缺陷病毒。急性期的诊断标准患者近期内有流行病学史和临床表现，HIV抗体筛查试验阳性或补充试验阳性。无症状期的诊断标准有流行病学史，结合HIV抗体阳性即可诊断，或仅实验室检查HIV抗体阳性即可诊断。艾滋病期的诊断标准有流行病学史、实验室检查HIV抗体阳性，加下述各项中的任何一项，即可诊断为艾滋病。或者HIV抗体阳性，而CD4+T淋巴细胞数＜200个/μl，也可诊断为艾滋病。不明原因的持续不规则发热38℃以上，＞1个月。腹泻（粪便次数多于3次/日），＞1个月。6个月之内体重下降10％以上。反复发作的口腔真菌感染。反复发作的单纯疱疹病毒感染或带状疱疹病毒感染。肺孢子菌肺炎（PCP）。反复发生的细菌性肺炎。活动性结核或非结核分枝杆菌病。深部真菌感染。中枢神经系统占位性病变；中青年人出现痴呆；活动性巨细胞病毒感染；弓形虫脑病；马尔尼菲青霉病；反复发生的败血症；皮肤黏膜或内脏的卡波西肉瘤、淋巴瘤。