手术是治疗代谢性白内障最基本、最有效的方法。此外，治疗全身代谢性疾病也十分重要。手术治疗目前主要采用白内障超声乳化联合人工晶体植入术或小切口白内障囊外摘除联合人工晶体植入术。2009年美国首次报道将飞秒激光系统应用于临床白内障手术，成为近年来白内障手术最重要的技术变革。内科治疗糖尿病患者应积极治疗糖尿病，控制血糖。对半乳糖性白内障患者给予无乳糖和无半乳糖饮食。对血钙过低者予维生素D、钙剂，必要时应用甲状旁腺制剂。对肝豆状核变性，排除体内过多的铜，阻止铜在组织内再沉淀。