复发性多软骨炎会造成多器官、多系统炎症或并发症，不但影响生活和美观，还会多对这些器官的功能造成严重影响，严重时甚至会导致死亡。外耳廓松弛、塌陷、畸形和局部色素沉着、“鞍鼻”畸形、皮肤损害会影响美观。耳廓软骨炎波及到外耳道、中耳、咽鼓管可导致传导性耳聋；波及到内耳可导致听力下降和（或）前庭功能受损。累及眼部时，可出现巩膜炎、巩膜外层炎、结膜炎、葡萄膜炎、视网膜血管炎或视神经炎，对视力会产生影响。咽喉、气管和气管软骨炎症反复发作，支持结构塌陷，会导致肺炎、呼吸困难甚至窒息。此外，还可导致心肌炎、心内膜炎或心脏传导阻滞、主动脉瓣关闭不全、关节炎、肾炎等多种并发症。