医生主要是依据临床表现，结合非特异性炎症指标检测、病毒学检查、心脏磁共振、心电图、胸部X线检查、超声心动图检查结果，并且排除其他心脏疾病后，做出诊断的。患者发病前有病毒感染的症状，如发热、乏力、全身肌肉酸痛或恶心、呕吐等。出现心悸、胸痛、呼吸困难、头晕、水肿等症状。非特异性炎症指标检测，如红细胞沉降率增快，C-反应蛋白、血清肌钙蛋白水平增高等。病毒学检查，可从咽拭子、粪便、心肌组织中分离病毒或用PCR技术检测病毒RNA；血清中发现特异性抗病毒抗体。心脏磁共振、心电图、胸部X线检查、超声心动图检查发现心脏结构和功能有受损情况，并且排除了心脏其他疾病。