医生需要根据临床表现和检查结果，做出诊断。有典型的反流症状（胸骨后烧灼感、反酸），内镜下发现食管炎，并排除其他原因引起的食管炎，就可以诊断为反流性食管炎。如果内镜下没有发现食管炎，此时需要结合食管pH监测的结果，若食管pH监测阳性，也可以确立诊断。如果仅有咽喉炎、哮喘、咳嗽等不典型的症状，结合内镜发现食管炎、食管反流监测阳性，也可以确立诊断。