反流性食管炎的治疗效果与治疗方法有关。药物治疗可以使大部分患者的反流症状得到缓解，但不容易从根本上治愈，一旦停药容易复发。内镜下抗反流手术的长期疗效和并发症，目前尚没有定论，还需进一步评估。手术治疗不能根治本病，但对于无法停药且符合手术条件的患者，手术治疗比终身服药要好，控制反流症状的效果也比药物疗效要好。