脊索瘤通常分为4期。Ⅰ期：局限于原发部位，无邻近部位侵犯。Ⅱ期：肿瘤向原发部位周围间隙或组织结构侵犯，只累及一个颅底解剖间隙；脊柱肿瘤则累及椎弓根。Ⅲ期：累及两个颅底间隙，脊椎肿瘤为累及整节脊柱。Ⅳ期：累及两个以上颅底间隙，脊柱肿瘤为累及椎旁软组织或向椎管内侵犯，复发或伴有转移病例。