由于甲状腺舌管囊肿有可能合并感染，并易形成瘘管，故本病一经确诊，多主张尽快手术治疗，其他治疗措施多无效。手术治疗手术时机：颈部甲状舌管囊肿无感染者，1岁以上手术比较安全，如有感染趋势者，应尽早手术。术后复发率：手术后，复发率约为3%～5%，多数在术后1年之内复发，再次手术难度明显增大。因此，必须尽可能提高首次手术的成功率。其他治疗当合并有感染时可用药物治疗，控制感染后早期手术治疗。