确诊甲状腺囊肿主要依靠体格检查、实验室检查、超声检查、放射性核素显像及细针抽吸细胞学检查。体格检查：触诊颈部肿块的部位、大小、性质、活动度等，可初步诊断。实验室检查：甲状腺功能，了解甲状腺功能指标有无异常。超声检查：是甲状腺囊肿确诊的依据。放射性核素显像：有助于确诊。细针抽吸细胞学检查：属于有创检查，有助于及早发现囊肿是否合并癌变。