预后与诊治是否及时、致病菌的毒力、感染源、患者年龄等因素有关。心源性、肺源性和多发性脑脓肿预后差；婴幼儿患者预后较成人差。常遗留症状性癫痫、脑积水，各种神经系统病残，如肢体瘫痪、失语等后遗症。