囊性肾病的预后与其类型有关。总体来说，早期、规范治疗，对于取得满意的治疗效果有重要意义。单纯性肾囊肿，经治疗后可以治愈。多囊肾，患者肾功能呈渐进性减退，经积极治疗后，可以延缓病情的发展，但最终进入肾功能衰竭期，出现尿毒症。肾髓质囊性病，预后良好，很少发生肾功能不全。