新生儿只会用鼻子呼吸，因此双侧闭锁和单侧闭锁的症状略有不同。先天性单侧后鼻孔闭锁在吃奶时可出现气急，平时可无明显症状。先天性双侧后鼻孔闭锁出生后即出现严重的呼吸困难、发绀甚至窒息死亡。当张口啼哭时，呼吸困难和发绀反而显著改善或消失，吃奶或闭口时呼吸困难再次加重，并出现发绀，从而导致喂养困难。随着年龄的增长，患儿的闭塞性鼻音愈来愈明显，鼻内有胶冻样涕,难以擤出，睡眠时有鼾症和呼吸暂停综合征，经常困倦嗜睡。