唾液不能下咽、反流入口腔，出生后即有流口水、吐白沫。每次哺乳乳汁不能进入胃中，可溢入呼吸道。合并有气管食管瘘时乳汁直接进入气管引起呛咳、呕吐、呼吸困难、唇面及甲床青紫、呼吸道空气进入胃肠引起腹胀等。