腹痛、腹泻、便血等症状反复发作，会影响生活和工作。对于溃疡性结肠炎患者，炎症和溃疡累及结肠和直肠。而对于克罗恩病患者，炎症可累及胃肠道的任何部位，但最常见的部位是小肠末段或大肠，反复发作的炎症形成溃疡，不易治愈。重症溃疡性结肠炎患者可并发中毒性巨结肠，本并发症预后差，易引起急性肠穿孔。炎症性肠病长期不愈有癌变的风险。国外有报道发病20年和30年后癌变 率分别为7.2％和16.5％。