确诊输尿管结石需要进行体格检查、尿液检查、影像学检查。体格检查医生会按压腹部两侧及叩击腰背部，根据压痛部位，可初步判断结石位置。尿液检查包括尿常规、尿培养及药物敏感试验。通过尿液检查，可以判断是否存在泌尿系统感染或损伤，还可明确病原菌类型。影像学检查腹部X线90%以上的结石可通过X线发现。X线显影的深浅与结石的化学成分、大小和厚度有关。B超能发现X线平片上不能显示的小结石和透X线结石。可了解结石梗阻对肾脏结构的影响，如积水程度，肾盂肾盏的扩张情况。CT对X线不显影的尿酸结石，CT可以确诊。输尿管镜及肾镜检查对腹部X线平片未显示结石，静脉尿路造影有充盈缺损而不能确诊时，通过此检查可以进行诊断及鉴别诊断。