体积大的肾囊肿，可以直接对肾脏产生压迫作用，影响肾脏的功能。特殊部位的肾囊肿，比如肾盂旁肾囊肿，可以压迫肾盂及输尿管起始段，引起肾积水影响肾功能。少数肾囊肿，囊壁局部增厚不光滑，属于囊性肾癌，有远处转移，危及生命的风险。