病因常与接触外界致癌因素有关，染料、皮革、橡胶、油漆等工业原料中的芳香伯胺类物质如联苯胺等是肾盂癌致癌物质；色氨酸代谢紊乱、长期吸烟及服用非那西丁类药物者，肾盂癌发病率明显增高；受到感染或长期结石刺激可引起比较少见的鳞癌或腺癌，有些囊性肾盂炎、腺性肾盂炎可发展为肾盂癌。