浙江中医药大学附属第三医院庆春路院区设有以下科室:
中医内科
中医外科
中医妇科
中医儿科
中医皮肤科
中医眼科
中医耳鼻咽喉科
中医口腔科
中医肿瘤科
中医骨伤科
中医肛肠科
中医推拿科
中医针灸科
中医康复科
西医内科
西医外科
西医妇产科
西医儿科
西医皮肤科
西医眼科
西医耳鼻咽喉科
西医口腔科
西医肿瘤科
西医骨伤科
西医肛肠科
西医急诊科
麻醉科
医学检验科
医学影像科
病理科
药剂科
营养科
高压氧治疗科
重症医学科
健康体检中心