青岛市市立医院东院设有以下科室:
心血管内科
神经内科
呼吸与危重症医学科
消化内科
内分泌科
血液肿瘤内科
肾内科
风湿免疫科
干部保健科
老年医学科
全科医学科
康复医学科
疼痛科
中医康复科
感染性疾病科
急诊科
重症医学科
儿科
妇科
产科
生殖医学科
眼科
耳鼻咽喉科
口腔科
皮肤科
麻醉科
医学检验科
输血科
超声医学科
医学影像科
核医学科
放疗科
药剂科
临床营养科
检验科
病理科
手术室
供应室
内镜中心
健康管理中心