首都医科大学附属朝阳医院设有呼吸与危重症医学科、心脏中心、急诊科、妇产科、儿科、眼科、口腔科、皮肤科、中医科、麻醉科、检验科、超声医学科、病理科、药学部、职业病与中毒医学科、变态反应科、核医学科、放射科、检验科、病理科、微创神经外科等科室。
