首都医科大学附属北京安贞医院设有44个临床科室、14个医技科室。拥有国家临床重点专科11个（小儿心脏科、小儿外科、小儿心内科、小儿心胸外科、妇产科、麻醉科、泌尿外科、眼科、耳鼻咽喉头颈外科、皮肤科、胸外科）。
