四川大学华西医院是中国西部疑难危急重症诊疗的国家级中心,也是世界规模第一的综合性单点医院,拥有 4 个国家重点实验室。其全部院区的科室设置如下:
华西院区(位于四川省成都市武侯区国学巷 37 号):设有心血管内科、神经内科、呼吸内科、消化内科、血液内科、肿瘤科、骨科、肾脏内科、内分泌代谢科、风湿免疫科、感染性疾病中心、老年医学中心、普通外科、胸外科、心脏大血管外科、神经外科、小儿外科、骨科、泌尿外科、肝脏外科、烧伤整形科、血管外科、康复医学科、疼痛科、器官移植中心、精神科、心理卫生中心、检验科、病理科、核医学科、超声医学科、放射科、药剂科等科室。
温江院区(位于成都市温江区永宁镇芙蓉大道三段 363 号):设有健康管理中心。
上锦院区(位于成都市高新西区尚锦路 253 号):设有重症医学科、心血管内科、神经内科、呼吸内科、消化内科、血液内科、肿瘤科、骨科、肾脏内科、内分泌代谢科、风湿免疫科、感染性疾病中心、老年医学中心、普通外科、胸外科、心脏大血管外科、神经外科、小儿外科、骨科、泌尿外科、肝脏外科、烧伤整形科、血管外科、康复医学科、疼痛科、器官移植中心、精神科、心理卫生中心、检验科、病理科、核医学科、超声医学科、放射科、药剂科等科室。