沈阳市口腔医院设有口腔颌面外科、口腔内科、口腔修复科、口腔正畸科、儿童口腔科、口腔预防科、口腔综合科、特诊科、牙体牙髓科、牙周黏膜病科、口腔种植科、口腔麻醉科、检验科、放射线科、药剂科等临床和医技科室。