国家康复辅具研究中心附属康复医院设有以下科室:
脊柱脊髓损伤康复科
骨与关节康复科
神经康复科
儿童康复科
老年康复科
心肺康复科
疼痛康复科
中医康复科
康复工程研究所
康复评定科
假肢矫形部
民政部残疾儿童康复中心
北京市假肢矫形技术中心
全国假肢科技情报中心
国家康复辅具质量监督检验中心